Ну как так не было пользователей? АОС вроде сам по себе на уже готовой базе синхронизации не запускает. Т.е. вот прям по журналу работы пользователей никто примерно в это время не логинился, никакие пакетные задания не запускались, через business connector никто не ломился?.. Чудес ведь не бывает