Походил по ссылкам, наткнулся на
http://forum.mazzy.ru/index.php?showtopic=1790
Розничные продажи - как раз получают описанные проблемы, потому что там строк в документах дофига (счет идет на тысячи), и проблема не только в индексах и БД, а в кривом коде, который зря грузит сервер приложений.