Мониторинг запросов? Профайлер? Реиндексация? Необходимо найти конкретный код, который тормозит. Вряд ли имеет смысл нам угадывать, когда вы очень быстро это сами сможете сделать. Ну а по результатам уже можно думать о том что делать и как быть.
http://axapta.mazzy.ru/lib/querytuning/