Аскапта рассчитывает себестоимость в разрезе аналитик, помеченных признаком "Финансовый склад" в настройке группы складских аналитик. Т.е. достаточно пометить только склад (правда, это не прокатит для 2009 - там вроде как нельзя отключить сайт)
В 2009 снять галку "Финансовый склад" с Сайта нельзя, но можно сам Сайт не включать