Товарные издержки криво распределились - как скорректировать лучше?

[Sancho]

делайте кредит ноту покупки издержек
распределяйте на приходную операцию пропорционально стоимости
на третью проводку наверняка упадет ноль, это будет видно как результат распределения, поправьте если что не так ручками.
учитывайте.
впредь распределяйте не пропорционально стоимости (раз у вас это не работает), а как-то по другому.